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青海新聞網(wǎng)·大美青海客戶端訊 記者從青海省科技廳了解到，11月12日，中國科學院西北高原生物研究所研究員張同作聯(lián)合青海大學副教授魏青等團隊，成功組裝了藏羚染色體級別的基因組，首次獲得藏羚染色體水平的高質(zhì)量基因組和注釋信息，相關(guān)研究結(jié)果在《自然》旗下綜合性科學期刊《科學數(shù)據(jù)》上發(fā)表。
研究團隊基于PacBio HiFi三代基因組測序、Hi-C測序和DNBSEQ-T7二代基因組survey測序三種測序技術(shù)，成功組裝了藏羚染色體級別的基因組。基于EDTA和RepeatModeler從頭預測的藏羚基因組中重復序列注釋結(jié)果表明，藏羚基因組重復序列主要由SINEs、LINEs、LTRs和DNA transposons四種類型組成，序列總長度為1.65Gb，占基因組的52.47%；基于蛋白同源預測、蛋白從頭預測和深度學習等多種策略，在藏羚基因組上共注釋到28330個功能基因。
研究團隊首次獲得藏羚染色體水平的高質(zhì)量基因組和注釋信息，為藏羚的適應進化遺傳機制、保護遺傳學研究及進一步探索物種遷徙行為的遺傳機制提供了重要的基因組資源。